质谱仪与其他技术的结合：液相色谱（LC）  ，液相色谱（GC）  ，毛细管电泳（CE）和凝胶电泳（GE）是常见的示例 。与ICP-MS和DART-MS结合使用时  ，方法的组合尤为常见 。

1、气相色谱仪仪色谱质谱法（GC-MS） GC是一种种探讨/剥离技木设备  ，这之中将有难度的氧化物混合着物进入液相液相色谱柱中  ，并经由其对比水的沸点和对液相液相色谱柱的柔软性参与剥离 。GC中运用的温度使其不舒适用在夺原子核量氧化物（举例血清质）  ，正是因为这些会使卡路里性质发生变化 。它相对适用在中石化  ，情况数据监测和修整各类工业制造生物研究方向 。备样本质属性上就能够是夜体  ，夜体或有机废气气体 。剥离后  ，就能够经由质谱技木设备（举例ICP-MS）探讨氧化物以参与判定  ，或运用EI或CI将其阳离子化  ，进而在ToF产品质量探讨器17中参与探讨 。 2、高效液相色谱质谱法（LC-MS） LC与高效液质色谱似的  ，的不同地方内在样件现代始终出现高效液质睡眠模式 。将样件容解在石油醚中  ，第二添加到气相气相气相色谱柱中  ，该气相气相气相色谱柱由可融化合物（流量相）和固相（调整相）組成 。样件含量与气相气相气相色谱柱调整相之中的相对应责任心以至于样件含量脱离  ，第二也可以可以通过质谱验测 。伴随泄露物始终出现高效液质睡眠模式  ，因而此种脱离技術尤其最合适与ICP-MS和ESI-MS的方法组合用到  ，但也出现与铁离子阱和Orbitrap质谱仪涉及到的 。 3、热塑质谱（XL-MS） 理解多蛋清符合物的框架和组织性对于那些理解肿瘤细胞用途非常重要性 。有机化学上的热塑与质谱联用（XL-MS）是同一个种习惯  ，可与像地温電子透射电镜（cryo-EM）和Xx射线单晶体学累似的框架生物工程学技能互补性  ，但可具备较分太低辨率的框架新信息查询 。在XL-MS中  ，蛋清质或蛋清质符合物用热塑剂工作  ，该热塑剂会在蛋清质中的相应官能团主动接入共价键 。第二步将热塑的蛋清质用分解成该蛋清质的酶化解  ，并顺利通过LC-MS习惯定性分析得出混和物  ，以签定热塑的肽并决定其编码队列 。交错式地址的的位置具备了相关联时未研究探讨的平台的框架新信息查询 。如果  ，表示很很复杂  ，担心以此类习惯配制的土样比非热塑蛋清的化解物包含了的个性有机化学上的类型要多得多 。内在的的热塑肽的颗数随编码队列长短首次增长 。或许非常  ，XL-MS仍然同一个个要用的机器  ，可有助于搭建蛋清质-蛋清质主动角色的框架模板 。 4、氢互换质谱（HX-MS） 氢互相置换质谱（HX-MS）的指标看起来像于XL-MS的指标–探索多核球氨基酸等软型物  ，专门是是核球氨基酸等设备构造和能源系统学 。HX-MS的其优势是指以上事：它也可能监测稀硫酸中核球氨基酸等质的设备构造  ，如此不必心得；它仅需小量试品（500-1,000皮摩尔）；也可能探索根本无法纯化的核球氨基酸等质  ，另外也可能具体定性分析设备构造和能源系统学能够间的变现 。HX-MS合理利用无机化学不良反应  ，使核球氨基酸等质中的任何H氧分子型式与稀硫酸中的H氧分子型式连着互相置换 。比如将H2O水稀硫酸用重水（D2O）取代  ，则也可能能够此互相置换工作 。专门地  ，与氨基酸等主链N氧分子型式键合的H（也通称主链酰胺H）能用于监测核球氨基酸等质设备构造 。H与D的互相置换搞定后  ，也可能能够MS定性分析试品  ，以展示有关于存在小分子型式相结合  ，核球氨基酸等质拆叠的核球氨基酸等质设备构造变现的短信  ，或有关于未心得或恶化的情况合其它设备构造生物体学的核球氨基酸等质设备构造的短信的办法 。 5、基本材料輔助激光束解吸/电离质谱三维成像（MALDI-MSI） MALDI-TOF不是MS浅析的很棒能力  ，可是还就能够经由开始扫一扫软件网上平台  ，在反复射出机光的现状下连着扫一扫软件网上平台或经由扫一扫机光束来转化图案 。这种能力誉为基本材料捕助机光解吸/电离质谱成相（MALDI-MSI） 。所述到的图案可以以50-200mm直接的位置辨别好坏率带来有关的新型组识薄片的更多个人信息 。根据MALDI就是一种软电离能力  ，从而团伙个人信息难于永久保存  ，从而不是需要像荧光显微镜这样标记符号感求知欲的氧化物展开测试 。从而  ，它带来了“无标价签”成相的能力 。